沙漠甲鲶主要分布在中国的西北地区，包括甘肃、宁夏、青海和新疆等省份。由于生活在沙漠地区中，沙漠甲鲶有着极强的适应能力，能在干旱且寡水的环境中生存。

它们通常生活在沙漠中较大的水池、湖泊和河流中，喜欢栖息在沙滩下的淤泥中。然而，由于沙漠化的加剧和人类活动的影响，沙漠甲鲶的生存环境遭到了严重威胁，目前已被列为国家重点保护野生动物之一。